La frontière sous-Neptune a ouvert une nouvelle fenêtre sur la riche diversité des environnements planétaires au-delà du système solaire. La possibilité de mondes océaniques, avec des océans à l'échelle de la planète et des atmosphères riches en H2, élargit et accélère considérablement la recherche d'environnements habitables ailleurs.

La récente spectroscopie en transmission du JWST du monde océanique candidat K2-18 b dans l'infrarouge proche a permis de détecter pour la première fois les molécules carbonées CH4 et CO2 dans son atmosphère, dont la composition est conforme aux prédictions de conditions océaniques.

Les observations ont également fourni une indication provisoire de sulfure de diméthyle (DMS), un gaz biosignature possible, mais l'inférence était de faible signification statistique.

Nous rapportons un spectre de transmission dans l'infrarouge moyen de K2-18 b obtenu à l'aide de l'instrument MIRI LRS du JWST dans le domaine ∼6-12 μm. Le spectre montre des caractéristiques distinctes et est incompatible avec un spectre sans caractéristiques à 3,4σ de signification par rapport à notre modèle canonique.

Nous constatons que le spectre ne peut pas être expliqué par la plupart des molécules prédites pour K2-18 b, à l'exception du DMS et du disulfure de diméthyle (DMDS), également un gaz biosignature potentiel.

Nous rapportons de nouvelles preuves indépendantes de la présence de DMS et/ou de DMDS dans l'atmosphère à 3σ de signification, avec une abondance élevée (≳10 ppmv) d'au moins l'une des deux molécules.

D'autres observations sont nécessaires pour augmenter la robustesse des résultats et résoudre la dégénérescence entre le DMS et le DMDS. Les résultats soulignent également la nécessité de travaux expérimentaux et théoriques supplémentaires pour déterminer les sections efficaces de gaz biosignatures importants et identifier les sources abiotiques potentielles. Nous discutons des implications des résultats actuels pour la possibilité d'une activité biologique sur le K2-18 b.

Bienvenue à tous ! Dans ce billet, nous allons examiner caractère par caractère le code source du vaccin ARNm SARS-CoV-2 de BioNTech/Pfizer.

Mise à jour : après que plus de 1,7 million de personnes ont visité cette page, j'ai décidé d'écrire un livre sur un thème similaire. Pour devenir un lecteur bêta, rendez-vous sur cette page consacrée à la technologie de la vie. Je vous remercie.

Je tiens à remercier les nombreuses personnes qui ont passé du temps à vérifier la lisibilité et l'exactitude de cet article. Toutes les erreurs restent les miennes, mais j'aimerais qu'on me les signale rapidement à l'adresse bert@hubertnet.nl ou @bert_hu_bert.

Le vaccin est un liquide que l'on s'injecte dans le bras. Comment parler de code source ?

C'est une bonne question, alors commençons par une petite partie du code source du vaccin BioNTech/Pfizer, également connu sous le nom de BNT162b2, également connu sous le nom de Tozinameran, également connu sous le nom de Comirnaty.
Les 500 premiers caractères de l'ARNm BNT162b2.

Source : Organisation mondiale de la santé : Organisation mondiale de la santé

Les 500 premiers caractères de l'ARNm BNT162b2.

Source : Organisation mondiale de la santé : Organisation mondiale de la santé

Le vaccin à ARNm BNT162b2 est constitué d'un code numérique. Il comporte 4 284 caractères, ce qui correspond à une série de tweets. Au tout début du processus de production du vaccin, quelqu'un a téléchargé ce code sur une imprimante à ADN (oui), qui a ensuite converti les octets sur le disque en véritables molécules d'ADN.

Une machine à ADN Kilobaser Express

De cette machine sortent de minuscules quantités d'ADN qui, après de nombreuses transformations biologiques et chimiques, se retrouvent sous forme d'ARN (nous y reviendrons) dans le flacon de vaccin. Une dose de 30 microgrammes contient en fait 30 microgrammes d'ARN. En outre, un astucieux système d'emballage lipidique (gras) permet d'introduire l'ARNm dans nos cellules.

Mise à jour : Derek Lowe, du célèbre blog In the pipeline de Science, a rédigé un article complet intitulé "RNA Vaccines And Their Lipids" (Les vaccins ARN et leurs lipides) qui explique clairement les éléments lipidiques et d'administration des vaccins que je ne suis pas en mesure de décrire. Heureusement, Derek l'est !

Mise à jour 2 : Jonas Neubert et Cornelia Scheitz ont écrit cette page impressionnante qui contient de nombreux détails sur la manière dont les vaccins sont produits et distribués. A recommander !

L'ARN est la version volatile de la "mémoire de travail" de l'ADN. L'ADN est en quelque sorte la mémoire flash de la biologie. L'ADN est très durable, redondant en interne et très fiable. Mais tout comme les ordinateurs n'exécutent pas le code directement à partir d'une clé USB, avant qu'un événement ne se produise, le code est copié dans un système plus rapide, plus polyvalent mais beaucoup plus fragile.

Pour les ordinateurs, il s'agit de la mémoire vive, pour la biologie, c'est l'ARN. La ressemblance est frappante. Contrairement à la mémoire flash, la RAM se dégrade très rapidement, à moins d'être entretenue avec amour. La raison pour laquelle le vaccin ARNm de Pfizer/BioNTech doit être stocké dans le plus profond des congélateurs est la même : l'ARN est une fleur fragile.

Chaque caractère d'ARN pèse de l'ordre de 0,53-10-²¹ gramme, ce qui signifie qu'il y a environ 6-10¹⁶ caractères dans une seule dose de vaccin de 30 microgrammes. Exprimé en octets, cela représente environ 14 pétaoctets, bien qu'il faille préciser qu'il s'agit d'environ 13 000 milliards de répétitions des mêmes 4 284 caractères. Le contenu informatif réel du vaccin dépasse à peine un kilo-octet. Le SARS-CoV-2 lui-même pèse environ 7,5 kilo-octets.

Mise à jour : dans le message original, ces chiffres étaient erronés. Voici une feuille de calcul avec les calculs corrects.

Le contexte le plus bref

L'ADN est un code numérique. Contrairement aux ordinateurs, qui utilisent 0 et 1, la vie utilise A, C, G et U/T (les "nucléotides", "nucléosides" ou "bases").

Dans les ordinateurs, nous stockons les 0 et les 1 sous la forme de la présence ou de l'absence d'une charge, d'un courant, d'une transition magnétique, d'une tension, d'une modulation d'un signal ou d'un changement de réflectivité. En bref, le 0 et le 1 ne sont pas une sorte de concept abstrait - ils vivent sous la forme d'électrons et dans de nombreuses autres incarnations physiques.

Dans la nature, A, C, G et U/T sont des molécules, stockées sous forme de chaînes dans l'ADN (ou l'ARN).

Dans les ordinateurs, nous regroupons 8 bits en un octet, et l'octet est l'unité typique des données traitées.

La nature regroupe 3 nucléotides en un codon, et ce codon est l'unité typique de traitement. Un codon contient 6 bits d'information (2 bits par caractère d'ADN, 3 caractères = 6 bits. Cela signifie que 2⁶ = 64 valeurs de codon différentes).

Pour l'instant, c'est plutôt numérique. En cas de doute, consultez le document de l'OMS contenant le code numérique pour vous en convaincre.

Des lectures complémentaires sont disponibles ici - ce lien ("Qu'est-ce que la vie") peut aider à comprendre le reste de cette page. Ou, si vous aimez les vidéos, j'ai deux heures pour vous.

Que fait ce code ?

L'idée d'un vaccin est d'apprendre à notre système immunitaire à combattre un agent pathogène, sans que nous tombions malades. Historiquement, cela s'est fait par l'injection d'un virus affaibli ou incapacité (atténué), plus un "adjuvant" pour effrayer notre système immunitaire et le pousser à agir. Il s'agissait d'une technique résolument analogique impliquant des milliards d'œufs (ou d'insectes). Elle nécessitait également beaucoup de chance et de temps. Parfois, un virus différent (non apparenté) était également utilisé.

Un vaccin à ARNm permet d'atteindre le même objectif ("éduquer notre système immunitaire"), mais à la manière d'un laser. Et je l'entends dans les deux sens du terme : très étroit mais aussi très puissant.

Voici donc comment cela fonctionne. L'injection contient du matériel génétique volatil qui décrit la fameuse protéine "Spike" du SRAS-CoV-2. Par des moyens chimiques astucieux, le vaccin parvient à introduire ce matériel génétique dans certaines de nos cellules.

Celles-ci se mettent alors consciencieusement à produire des protéines Spike du SRAS-CoV-2 en quantités suffisamment importantes pour que notre système immunitaire entre en action. Confronté aux protéines Spike et aux signes révélateurs de la prise de contrôle des cellules, notre système immunitaire développe une réponse puissante contre de multiples aspects de la protéine Spike ET du processus de production.

C'est ce qui nous permet d'obtenir un vaccin efficace à 95 %.

Le code source !

Commençons par le tout début, un très bon point de départ. Le document de l'OMS contient cette image utile :

Il s'agit d'une sorte de table des matières. Nous commencerons par la "casquette", qui est en fait un petit chapeau.

De la même manière qu'on ne peut pas simplement placer des opcodes dans un fichier sur un ordinateur et l'exécuter, le système d'exploitation biologique a besoin d'en-têtes, d'éditeurs de liens et de conventions d'appel.

Le code du vaccin commence par les deux nucléotides suivants :

GA

Cela peut être comparé à tous les exécutables DOS et Windows commençant par MZ, ou aux scripts UNIX commençant par # ! Dans la vie comme dans les systèmes d'exploitation, ces deux caractères ne sont en aucun cas exécutés. Mais ils doivent être présents, car sinon rien ne se passe.

Le "cap" de l'ARNm a un certain nombre de fonctions. Tout d'abord, il indique que le code provient du noyau. Dans notre cas, ce n'est évidemment pas le cas, notre code provient d'une vaccination. Mais nous n'avons pas besoin de le dire à la cellule. Le capuchon donne à notre code une apparence légitime, ce qui le protège de la destruction.

Les deux nucléotides initiaux de l'AG sont également chimiquement légèrement différents du reste de l'ARN. En ce sens, l'AG est doté d'une signalisation hors bande.

La "région non traduite en cinq points" (five-prime untranslated region)

Un peu de jargon ici. Les molécules d'ARN ne peuvent être lues que dans un seul sens. La partie où la lecture commence est appelée 5' ou "cinq-prime", ce qui peut prêter à confusion. La lecture s'arrête à l'extrémité 3' ou trois-prime.

La vie est constituée de protéines (ou de choses fabriquées par des protéines). Ces protéines sont décrites dans l'ARN. La transformation de l'ARN en protéines s'appelle la traduction.

Ici, nous avons la région 5' non traduite ("UTR"), ce qui fait que cette partie ne se retrouve pas dans la protéine :

GAAΨAAACΨAGΨAΨΨCΨCΨGGΨCCACAGACΨCAGAGAGAACCCGCCACC

C'est ici que nous rencontrons notre première surprise. Les caractères normaux de l'ARN sont A, C, G et U. U est également connu sous le nom de "T" dans l'ADN. Mais ici, nous trouvons un Ψ, que se passe-t-il ?

C'est l'un des aspects les plus intelligents du vaccin. Notre corps dispose d'un puissant système antivirus ("l'original"). C'est pourquoi les cellules ne sont pas très enthousiastes à l'égard de l'ARN étranger et s'efforcent de le détruire avant qu'il ne fasse quoi que ce soit.

C'est en quelque sorte un problème pour notre vaccin, qui doit se faufiler dans notre système immunitaire. Après de nombreuses années d'expérimentation, on a découvert que si le U de l'ARN est remplacé par une molécule légèrement modifiée, notre système immunitaire s'en désintéresse. Pour de vrai.

Ainsi, dans le vaccin BioNTech/Pfizer, chaque U a été remplacé par le 1-méthyl-3'-pseudouridylyl, désigné par Ψ. Ce qui est vraiment astucieux, c'est que bien que ce Ψ de remplacement apaise (calme) notre système immunitaire, il est accepté comme un U normal par les parties concernées de la cellule.

Dans le domaine de la sécurité informatique, nous connaissons également cette astuce : il est parfois possible de transmettre une version légèrement corrompue d'un message qui déroute les pare-feu et les solutions de sécurité, mais qui est tout de même acceptée par les serveurs dorsaux - qui peuvent alors être piratés.

Nous récoltons aujourd'hui les fruits de la recherche scientifique fondamentale menée dans le passé. Les découvreurs de cette technique Ψ ont dû se battre pour que leurs travaux soient financés puis acceptés. Nous devrions tous leur être très reconnaissants, et je suis sûr que les prix Nobel arriveront en temps voulu.

De nombreuses personnes ont demandé si les virus pouvaient également utiliser la technique Ψ pour déjouer nos systèmes immunitaires. En bref, c'est extrêmement improbable. La vie ne dispose tout simplement pas de la machinerie nécessaire pour fabriquer des nucléotides 1-méthyl-3'-pseudouridylyl. Les virus dépendent de la machinerie de la vie pour se reproduire, et cette machinerie n'existe tout simplement pas. Les vaccins ARNm se dégradent rapidement dans le corps humain et il est impossible que l'ARN modifié par le Ψ se réplique avec le Ψ encore présent. Le document "No, Really, mRNA Vaccines Are Not Going To Affect Your DNA" (Non, vraiment, les vaccins ARNm ne vont pas affecter votre ADN) est également intéressant à lire.

Ok, revenons à l'UTR 5'. Que font ces 52 caractères ? Comme tout ce qui existe dans la nature, presque rien n'a de fonction précise.

Lorsque nos cellules doivent traduire l'ARN en protéines, elles le font à l'aide d'une machine appelée ribosome. Le ribosome est une sorte d'imprimante 3D pour les protéines. Il ingère un brin d'ARN et, sur la base de celui-ci, il émet une chaîne d'acides aminés, qui se plient ensuite pour former une protéine.

C'est ce que nous voyons se produire ci-dessus. Le ruban noir en bas est l'ARN. Le ruban qui apparaît en vert est la protéine en cours de formation. Les éléments qui entrent et sortent sont les acides aminés et les adaptateurs qui leur permettent de s'insérer dans l'ARN.

Ce ribosome doit s'asseoir physiquement sur le brin d'ARN pour pouvoir travailler. Une fois installé, il peut commencer à former des protéines sur la base de l'ARN qu'il ingère. On peut donc imaginer qu'il ne peut pas encore lire les parties sur lesquelles il se pose en premier. Ce n'est là qu'une des fonctions de l'UTR : la zone d'atterrissage du ribosome. L'UTR fournit un "lead-in".

En outre, l'UTR contient également des métadonnées : quand la traduction doit-elle avoir lieu ? Et dans quelle mesure ? Pour le vaccin, les chercheurs ont utilisé l'UTR le plus "immédiat" qu'ils aient pu trouver, extrait du gène de la globine alpha. Ce gène est connu pour produire de manière robuste un grand nombre de protéines. Au cours des années précédentes, les scientifiques avaient déjà trouvé des moyens d'optimiser encore davantage cet UTR (selon le document de l'OMS), de sorte qu'il ne s'agit pas tout à fait de l'UTR de la globine alpha. C'est mieux.

Le peptide signal de la glycoprotéine S

Comme nous l'avons vu, le but du vaccin est d'amener la cellule à produire de grandes quantités de la protéine Spike du SARS-CoV-2. Jusqu'à présent, nous avons surtout rencontré des métadonnées et des "conventions d'appel" dans le code source du vaccin. Mais nous entrons maintenant dans le territoire des protéines virales proprement dites.

Cependant, il nous reste encore une couche de métadonnées. Une fois que le ribosome (de la splendide animation ci-dessus) a fabriqué une protéine, celle-ci doit encore aller quelque part. Cette destination est codée dans le "peptide signal de la glycoprotéine S (séquence leader étendue)".

Cela signifie qu'au début de la protéine, il y a une sorte d'étiquette d'adresse - codée comme faisant partie de la protéine elle-même. Dans ce cas précis, le peptide signal indique que la protéine doit sortir de la cellule par le "réticulum endoplasmique". Même le jargon de Star Trek n'est pas aussi sophistiqué que cela !

Le "peptide signal" n'est pas très long, mais lorsque nous examinons le code, nous constatons des différences entre l'ARN viral et l'ARN du vaccin :

(À des fins de comparaison, j'ai remplacé le Ψ modifié par un U d'ARN normal.)

       3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3

Virus : UG UUU GUUU UUU CUU GUU UUA UUG CCA CUA GUC UCU AGU CAG UGU GUU
Vaccin : AUG UUC GUG UUC CUG GUG CUG CUG CCU CUG GUG UCC AGC CAG UGU GUG
! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! !

Que se passe-t-il donc ? Ce n'est pas par hasard que j'ai classé l'ARN par groupes de 3 lettres. Trois caractères d'ARN constituent un codon. Et chaque codon code pour un acide aminé spécifique. Le peptide signal du vaccin se compose exactement des mêmes acides aminés que le virus lui-même.

Comment se fait-il alors que l'ARN soit différent ?

Il y a 4³=64 codons différents, puisqu'il y a 4 caractères d'ARN et qu'il y en a trois dans un codon. Pourtant, il n'y a que 20 acides aminés différents. Cela signifie que plusieurs codons codent pour le même acide aminé.

La vie utilise le tableau presque universel suivant pour établir la correspondance entre les codons de l'ARN et les acides aminés :

La table des codons de l'ARN (Wikipedia)

https://en.wikipedia.org/wiki/DNA_and_RNA_codon_tables

https://fr.wikipedia.org/wiki/Code_g%C3%A9n%C3%A9tique#Table_des_codons_d'ARN_messager

Dans ce tableau, nous pouvons voir que les modifications dans le vaccin (UUU -> UUC) sont toutes synonymes. Le code de l'ARN du vaccin est différent, mais il produit les mêmes acides aminés et la même protéine.

Si nous regardons de plus près, nous constatons que la majorité des modifications se produisent dans la troisième position du codon, notée par un "3" ci-dessus. Et si l'on consulte le tableau des codons universels, on constate que cette troisième position n'a souvent pas d'importance pour l'acide aminé qui est produit.

Les changements sont donc synonymes, mais alors pourquoi sont-ils là ? En y regardant de plus près, nous constatons que tous les changements, sauf un, conduisent à davantage de C et de G.

Pourquoi donc ? Comme indiqué plus haut, notre système immunitaire voit d'un très mauvais œil l'ARN "exogène", c'est-à-dire le code ARN provenant de l'extérieur de la cellule. Pour échapper à la détection, le "U" de l'ARN a déjà été remplacé par un "Ψ".

Or, il s'avère que l'ARN contenant une plus grande quantité de G et de C est également converti plus efficacement en protéines,

C'est ce qui a été fait dans l'ARN du vaccin en remplaçant de nombreux caractères par des G et des C lorsque cela était possible.

Je suis légèrement fasciné par la seule modification qui n'a pas entraîné l'ajout d'un C ou d'un G, à savoir la modification CCA -> CCU. Si quelqu'un en connaît la raison, qu'il me la communique ! Je suis conscient que certains codons sont plus fréquents que d'autres dans le génome humain, mais j'ai également lu que cela n'influençait pas beaucoup la vitesse de traduction. MISE À JOUR : un certain nombre de lecteurs ont fait remarquer que ce changement pourrait empêcher la formation d'une "épingle à cheveux" dans l'ARN. Vous pouvez faire l'essai vous-même sur le service RNAFold.

Ce merveilleux article de Chelsea Voss traite en profondeur de la forme et du contenu de l'ARN du SARS-CoV-2.

La protéine Spike proprement dite

Les 3 777 caractères suivants de l'ARN du vaccin sont également "optimisés par codon" pour ajouter de nombreux C et G. Pour des raisons d'espace, je ne vais pas énumérer tout le code ici, mais nous allons nous concentrer sur un élément exceptionnellement spécial. Dans un souci d'espace, je n'énumérerai pas ici tout le code, mais nous allons nous concentrer sur une partie exceptionnellement spéciale. Il s'agit de la partie qui fait fonctionner le système, celle qui nous aidera à retrouver une vie normale :

              * *
      L D K V E A E V Q I D R L I T G

Virus : CUU GAC AAA GUU GAG GCU GAA GUG CAA AUU GAU AGG UUG AUC ACA GGC
Vaccin : CUG GAC CCU CCU GAG GCC GAG GUG CAG AUC GAC AGA CUG AUC ACA GGC
L D P P E A E V Q I D R L I T G
! ! !! ! ! ! ! ! ! ! ! !

Nous voyons ici les changements synonymes habituels de l'ARN. Par exemple, dans le premier codon, nous voyons que CUU est transformé en CUG. Cela ajoute un "G" supplémentaire au vaccin, ce qui, nous le savons, contribue à améliorer la production de protéines. CUU et CUG codent tous deux pour l'acide aminé "L" ou leucine, de sorte que rien n'a changé dans la protéine.

Lorsque nous comparons l'ensemble de la protéine Spike dans le vaccin, tous les changements sont synonymes, à l'exception de deux, et c'est ce que nous voyons ici.

Les troisième et quatrième codons ci-dessus représentent des changements réels. Les acides aminés K et V y sont tous deux remplacés par "P" ou Proline. Pour 'K', cela a nécessité trois changements ('!!!') et pour 'V', cela n'en a nécessité que deux ('!!').

Il s'avère que ces deux modifications améliorent considérablement l'efficacité du vaccin.

Que se passe-t-il donc ici ? Si l'on observe une vraie particule de SRAS-CoV-2, on peut voir la protéine Spike sous la forme d'une série de pointes :
Particules du virus du SRAS (Wikipedia)

Particules du virus du SRAS (Wikipedia)

Les pointes sont montées sur le corps du virus ("la protéine de la nucléocapside"). Mais le fait est que notre vaccin ne génère que les pics lui-même, et que nous ne les montons sur aucune sorte de corps viral.

Il s'avère que, non modifiées, les protéines Spike indépendantes s'effondrent en une structure différente. Si elles étaient injectées sous forme de vaccin, notre corps développerait une immunité... mais uniquement contre la protéine Spike effondrée.

Et le vrai SARS-CoV-2 apparaît avec la protéine Spike. Le vaccin ne fonctionnerait pas très bien dans ce cas.

Que faire alors ? En 2017, il a été décrit comment la substitution d'une double proline au bon endroit permettait aux protéines S du SRAS-CoV-1 et du MERS d'adopter leur configuration "pré-fusion", même si elles ne font pas partie de l'ensemble du virus. Cela fonctionne parce que la proline est un acide aminé très rigide. Elle agit comme une sorte d'attelle, stabilisant la protéine dans l'état que nous devons montrer au système immunitaire.

Les personnes qui ont découvert cela devraient se féliciter sans cesse. Une insoutenable suffisance devrait émaner d'eux. Et ce serait bien mérité.

Mise à jour ! J'ai été contacté par le laboratoire McLellan, l'un des groupes à l'origine de la découverte de la proline. Ils me disent que les applaudissements sont discrets en raison de la pandémie en cours, mais qu'ils sont heureux d'avoir contribué à la mise au point des vaccins. Ils soulignent également l'importance de nombreux autres groupes, travailleurs et bénévoles.

La fin de la protéine, les prochaines étapes

Si nous parcourons le reste du code source, nous rencontrons quelques petites modifications à la fin de la protéine Spike :

      V L K G V K L H Y T s

Virus : GUG CUC AAA GGA GUC AAA UUA CAU UAC ACA UAA
Vaccin : GUG CUG AAG GGC GUG AAA CUG CAC UAC ACA UGA UGA
V L K G V K L H Y T s s
! ! ! ! ! ! ! !

À la fin d'une protéine, on trouve un codon "stop", désigné ici par un "s" minuscule. C'est une façon polie de dire que la protéine doit s'arrêter ici. Le virus original utilise le codon stop UAA, le vaccin utilise deux codons stop UGA, peut-être juste pour faire bonne mesure.

La région 3' non traduite

Tout comme le ribosome avait besoin d'une introduction à l'extrémité 5', où nous avons trouvé la "région non traduite", à l'extrémité de la région codante d'une protéine, nous trouvons une construction similaire appelée "3' UTR".

Il y aurait beaucoup à dire sur l'UTR 3', mais je cite ici ce que dit Wikipedia : ''"La région 3'-non traduite joue un rôle crucial dans l'expression des gènes en influençant la localisation, la stabilité, l'exportation et l'efficacité de la traduction d'un ARNm ... malgré notre compréhension actuelle des UTR 3'-, ils restent encore des mystères relatifs".''

Ce que nous savons, c'est que certains 3'-UTR parviennent très bien à promouvoir l'expression des protéines. Selon le document de l'OMS, le 3'-UTR du vaccin BioNTech/Pfizer a été choisi parmi "l'ARNm de l'AES (amino-terminal enhancer of split) et l'ARN ribosomal 12S codé pour la mitochondrie afin de conférer une stabilité à l'ARN et une expression totale élevée de la protéine". Ce à quoi je réponds : "Bravo !

La fin de la AAAAAAAAAAAAAAAAAA

L'extrémité de l'ARNm est polyadénylée. C'est une façon élégante de dire qu'il se termine par un grand nombre de AAAAAAAAAAAAAAAAA. Il semble que même l'ARNm en ait assez de 2020.

L'ARNm peut être réutilisé de nombreuses fois, mais il perd alors une partie des A à la fin. Une fois les A épuisés, l'ARNm n'est plus fonctionnel et est éliminé. De cette manière, la queue "poly-A" est protégée de la dégradation.

Des études ont été menées pour déterminer le nombre optimal de A à l'extrémité des vaccins ARNm. J'ai lu dans la littérature ouverte que ce nombre atteignait environ 120.

Le vaccin BNT162b2 se termine par :

                                 ****** ****

UAGCAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAGCAUAU GACUAAAAAA AAAAAAAAAA
AAAAAAAAAA AAAAAAAA AAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAA AAAAAAAA

Il s'agit de 30 A, puis d'un "linker" de 10 nucléotides (GCAUGACU), suivi de 70 A supplémentaires.

Il existe plusieurs théories sur la raison de la présence de ce linker. Certains me disent que cela a à voir avec la stabilité des plasmides d'ADN, ce qu'un expert m'a également confirmé :

"Le linker de 10 nucléotides dans la queue du poly(A) facilite l'assemblage des fragments d'ADN synthétique qui deviennent la matrice pour la transcription de l'ARNm. Il réduit également le glissement de l'ARN polymérase T7, de sorte que la longueur de l'ARNm transcrit est plus uniforme".

L'article "Segmented poly(A) tails significantly reduce recombination of plasmid DNA without affecting mRNA translation efficiency or half-life" (Queues poly(A) segmentées réduisent significativement la recombinaison de l'ADN plasmidique sans affecter l'efficacité de la traduction de l'ARNm ou sa demi-vie) contient également une description convaincante de la manière dont un lien peut améliorer l'efficacité.

Résumer

Nous connaissons maintenant le contenu exact de l'ARNm du vaccin BNT162b2 et, pour la plupart des éléments, nous comprenons pourquoi ils sont là :

• Le CAP pour s'assurer que l'ARN ressemble à un ARNm normal
• Une région 5' non traduite (UTR) optimisée et réussie.
• un peptide signal optimisé par codon pour envoyer la protéine Spike au bon endroit (acides aminés copiés à 100 % à partir du virus d'origine)
• Une version optimisée par codon du spike original, avec deux substitutions de "Proline" pour s'assurer que la protéine apparaît sous la bonne forme.
• Une région 3' non traduite connue et optimisée
• Une queue poly-A avec un "linker".

L'optimisation des codons ajoute beaucoup de G et de C à l'ARNm. Parallèlement, l'utilisation de Ψ (1-méthyl-3'-pseudouridylyl) au lieu de U permet d'échapper à notre système immunitaire, de sorte que l'ARNm reste dans les parages suffisamment longtemps pour que nous puissions réellement contribuer à la formation du système immunitaire.

Comment la mauvaise compréhension de la dynamique des populations de Loup par le conseiller fédéral Suisse Albert Rösti (et beaucoup trop d'autres membres de la classe politique ) va avoir l'effet inverse de celui voulu.

Si on tue maintenant beaucoup de loups ils deviendrons encore plus reproductifs!
(et avec une sélection des plus agressifs ?)

Les exponentielles infinies... ça n'existe pas. Il y a toujours un moment où le réel des ressources vient cesser l'exponentielle (à méditer pour le PIB !!) Pour la population de loup, c'est pareil. Au bout d'un moment la population se stabilise.

Sauf que si on tire les loups avant la stabilisation, on va créer une pression sélective pour la conquête des territoires artificiellement vidés et donc une pression à la reproduction très rapide du loup.
(c'est la même stratégie qu'on applique à l'élevage de saumon pour augmenter la productivité)

De plus, aucun loup ne survivrais en hiver si il n'y avait pas autre chose à manger que des moutons (qui l'hiver sont à la bergerie).

Donc le garde manger du loup c'est PAS les moutons. C'est le cerf et le chevreuil.

Il y a une nette corrélation entre la population de cervidé et celle du loup.

.. et là c'est même un avantage d'avoir des loups, car actuellement on doit artificiellement chasser le cerf et le chevreuil. pour conserver un équilibre écologique. C'est un soucis pour l'état suivant les régions.

Si on laissait la population de loup s'équilibrer, on résout le problème de la surpopulation de cervidé !

Il y a de nombreux exemples de cycles écologiques (comme celui très connu du Parc de Yellowstone) qui montre que les grands prédateurs sont nécessaires pour la régulation globale. (notamment le captage de Co2, le rajeunissement des forêts, la limitation des inondations et glissement de terrain..)

Quand au mythe du grand méchant loup pour l'homme....
Une vaste étude faite dans plusieurs pays depuis 1950 montre qu'on a en 70 ans moins de cas d'attaque de loup sur des humains que de doigts dans une mains !! et que c'était majoritairement des attaques de loup enragé. Donc il faut combattre la rage et pas le loup !
(et se méfier des chiens et des voitures qui font nettement plus de morts...)

Dans un ecosystème naturel, la nourriture du loup c'est le cerf et le chevreuil. Il est donc nécessaire de laisser faire pour atteindre cet état sans le perturber en amont au risque d'avoir l'effet inverse voulu.

De la fin des années 2000 au milieu des années 2010, j'ai travaillé en tant que biologiste moléculaire pour une entreprise de sécurité nationale dans le cadre d'un programme d'étude des organismes exo-biosphériques (EBO). L'objectif du programme était d'élucider les bases du génome et du protéome de ces organismes. Bien que l'étude des EBO se poursuive depuis des décennies dans le cadre d'autres programmes, les nouvelles technologies de séquençage de l'ADN à haut débit de la fin des années 90 ont permis de débloquer la recherche qui stagnait dans ce domaine. Depuis lors, plusieurs percées ont permis des avancées significatives dans notre compréhension du génome et du protéome de ces êtres. Ce que nous avons appris jusqu'à présent nous a permis d'esquisser des perspectives déconcertantes quant à notre place dans cet univers. En bref, nous avons découvert que le génome des EBO est une chimère de génomes provenant de notre biosphère et d'une biosphère inconnue. Il s'agit d'organismes artificiels, éphémères et jetables, créés dans un but qui nous échappe encore en partie. Après une brève introduction, j'étayerai mes affirmations.

La raison pour laquelle je révèle ces secrets est très simple. Je pense que tout être humain a le droit de connaître la vérité, et que pour progresser, l'humanité doit se défaire de certaines institutions et organisations qui ne survivront probablement pas à long terme à ces révélations. Je suis conscient que je n'aurai que très peu d'impact à cet égard, mais je crois toujours que de petites fuites sont nécessaires pour briser le barrage de la désinformation sur ce sujet. Lorsque les gouvernements finiront par révéler ces secrets, il y aura sans doute un bouleversement de la société, mais à mon avis, plus on attendra, plus ce sera grave. Je choisis de divulguer ce que je sais de manière anonyme par égoïsme, pour mon bien-être et celui de ma famille. Je suis conscient que cela diminue la portée et la crédibilité de mon message, mais c'est le maximum que je suis prêt à faire. J'ai choisi ce forum parce qu'il offre un bon compromis entre l'anonymat et la popularité. Afin de protéger mon anonymat, je serai volontairement vague, voire contradictoire, sur toutes les informations qui pourraient permettre de m'identifier (date, formation, rôle, etc.). Je vais même introduire des faux-fuyants à cet égard. Je tiens à préciser que toute information relative au sujet de la recherche ne sera pas traitée de cette manière.

Avant d'aller plus loin, veuillez m'excuser si vous avez du mal à comprendre ce que je vous explique. Certaines parties de mon texte sont très techniques. Il est difficile de trouver le bon équilibre entre la vulgarisation et l'explication scientifique. Je vais continuer en parlant de moi. Quel est l'intérêt de parler de moi en sachant que l'information sera forcément trompeuse ? Je veux simplement introduire une perspective sur le type de personnes qui y travaillent, des scientifiques normaux. Je suis titulaire d'un doctorat en biologie moléculaire. Je n'ai pas cherché activement à participer à ce programme, c'est plutôt un coup de chance qui m'a fait rencontrer l'un des scientifiques principaux. J'ai rencontré cette personne lors d'une conférence où je présentais un poster sur mes recherches de doctorat. Quand j'y repense, je ne crois pas qu'il ait été impressionné par ce que je présentais, car il s'agissait franchement d'un projet qui n'allait nulle part. Je pense qu'il s'agissait plutôt de l'aspect le plus important d'une vie professionnelle : l'attitude et la facilité avec laquelle vous établissez des contacts. Peu de temps après, j'ai obtenu mon diplôme et j'ai reçu un appel de cette personne me proposant un poste. À l'époque, tout indiquait que je devais travailler dans un laboratoire ordinaire.

J'ai passé une série de trois entretiens de plus en plus suspects, chacun dans un lieu différent, où ma formation et mes connaissances scientifiques devenaient de moins en moins pertinentes. Le premier entretien a eu lieu avec deux des principaux scientifiques, le deuxième et le troisième avec des personnes que je n'ai jamais revues et qui ne s'intéressaient manifestement pas à la science. Quelque temps après l'entretien, on m'a demandé de me rendre dans un quatrième lieu où ce qui semblait être un avocat d'affaires m'a présenté un accord de confidentialité. Il s'est assuré non seulement de m'expliquer chaque détail, mais aussi de me faire comprendre les conséquences d'un non-respect de cette clause.

Les premières semaines d'emploi ont été de loin les plus mémorables, bien que j'aie passé la majeure partie de ce temps dans une salle d'archives déprimante. La formation se compose presque exclusivement de lectures sur le sujet d'étude et vise à nous mettre à niveau. Il n'y a pas de Wikipedia secret ni même de livre de référence pour nous guider. Il n'y a que des rapports, des mémos, des présentations, des procédures et des modes opératoires normalisés. Ces documents portent presque exclusivement sur la biologie des EBO, mais il y en a aussi quelques-uns qui traitent d'autres sujets tels que leur alimentation, leur religion ou leur culture. Il n'y a pas de documents sur leur technologie.

Comme mentionné plus haut, l'objectif du projet est de mieux comprendre le génome et le protéome des EBO. Pour ce faire, une équipe d'une vingtaine de scientifiques, quatre scientifiques seniors et un directeur ont été impliqués. Les scientifiques, comme moi-même, avaient pour principale responsabilité d'effectuer le travail technique. Comme chaque scientifique avait, à ma connaissance, un doctorat, nous étions tous un peu surqualifiés pour ce qui est en fin de compte un travail de technicien. Les scientifiques seniors, qui font pleinement usage de leurs diplômes, avaient pour tâche de concevoir les essais et avaient une responsabilité de supervision. Ils sont également chargés de la formation des nouveaux employés et interviennent parfois pour des travaux techniques. Le directeur, bien sûr, est le responsable qui dicte les priorités aux scientifiques seniors. Il est rarement présent sur le site, et les rares fois où il l'est, c'est pour assister à des réunions. Outre le personnel scientifique, il y avait des agents de sécurité qui travaillaient pour l'un ou l'autre sous-traitant. Il n'y avait pas de personnel de soutien comme les concierges ou les agents d'entretien. Les scientifiques étaient responsables de ce type de travail. De plus, les contraintes logistiques font que chaque scientifique est en mesure de réaliser n'importe quelle activité technique.

Le laboratoire lui-même est situé à Fort Detrick, dans le Maryland, dans un bâtiment utilisé pour la recherche biomédicale légitime. Les opérations clandestines sont menées dans une partie restreinte du sous-sol, à l'abri des regards des travailleurs réguliers. Contrairement à ce que l'on pourrait imaginer, le niveau de biosécurité n'est pas maximal pour ce type de recherche. En effet, le laboratoire contenant les échantillons d'EBO ou les cultures de cellules dérivées est de niveau BSL3, tandis que le laboratoire où sont effectués les essais n'est que de niveau BSL2. La zone BSL3 de l'installation comprend une salle de congélation et un laboratoire de culture cellulaire et n'est accessible que par une antichambre depuis la section BSL2. Les carcasses d'EBO sont conservées dans des congélateurs horizontaux à une température nominale de -80°C. Pour maximiser la conservation de ces carcasses, elles sont conservées dans des sacs sous vide et l'air de la pièce est contrôlé pour minimiser l'humidité. Il n'y a que quatre corps et aucun n'est complet. Il est évident que ces créatures sont mortes à la suite d'un traumatisme important. Je n'ai jamais été témoin d'un accident de moto mortel, mais cela doit ressembler à cela. Il est admis qu'il y a plus de caracasses d'EBOs à d'autres endroits. Le laboratoire de culture cellulaire, comme son nom l'indique, est l'endroit où les lignées cellulaires dérivées des EBO sont cultivées et où les activités connexes sont réalisées. Je parlerai plus en détail de ces lignées cellulaires spécifiques ultérieurement. La partie BSL2 est principalement utilisée pour les essais, l'immunohistochimie, le génie génétique, l'immunocytochimie, le stockage, etc.

Il y a également un laboratoire de culture cellulaire, mais il est utilisé pour des lignées cellulaires plus traditionnelles. En dehors des laboratoires, il y a toutes les commodités que l'on peut trouver dans un bureau. Il convient de noter que l'accès à l'internet est limité aux cadres supérieurs. Il existe toutefois un intranet pour les besoins de la bio-informatique.

En ce qui concerne la biologie de ces êtres, je commencerai par parler de la génétique, puis de leur anatomie grossière et enfin de leurs systèmes biologiques. Par souci de clarté, les informations que je fournis ici sont une agrégation de ce que j'ai observé et de ce que j'ai lu. Je ferai de nombreuses comparaisons avec l'anatomie humaine car c'est la référence la plus logique.

La génétique :

Tout d'abord, j'aimerais parler de leur génétique. Leur génétique est comme la nôtre, basée sur l'ADN. Ce fait m'a laissé très perplexe lorsque je l'ai appris pour la première fois. Nous imaginons que les êtres d'une biosphère alternative auraient une génétique basée sur un système biochimique complètement étranger et, étonnamment, ce n'est pas le cas. Plusieurs conclusions peuvent être tirées de cette surprenante révélation. Celle qui vient immédiatement à l'esprit est que notre biosphère et la leur partagent un ancêtre commun. Ce sont des eucaryotes, c'est-à-dire que leurs cellules possèdent un noyau contenant du matériel génétique. Ce qui suggère que leur biosphère se serait séparée de la nôtre quelque temps après l'apparition de ce type d'organisme. Le terme Exo-Biospheric-Organism est en fait une erreur d'appellation, mais comme il s'agit d'un terme historique, il est toujours utilisé. Leur génétique est non seulement basée sur le même système génétique, mais elle est également compatible avec notre propre machinerie cellulaire. Cela signifie que vous pouvez prendre un gène humain et l'insérer dans une cellule EBO, et que ce gène sera traduit en protéine, et cela fonctionne bien sûr à l'inverse avec un gène humain inséré dans une cellule EBO. Il existe des différences importantes dans les modifications post-traductionnelles qui rendront la protéine finale non fonctionnelle, mais j'en parlerai plus tard. Leur génome est constitué de 16 chromosomes circulaires.

Vous êtes probablement familiarisé avec le concept de région intergénique ou "ADN poubelle". Il s'agit essentiellement de séquences d'ADN qui ne codent pas pour des protéines. Il s'agit de résidus évolutifs, de transposons, de gènes inactivés, etc. Pour vous donner une idée, chez l'homme, les régions intergéniques représentent environ 99 % de notre génome. Je sais que ces séquences ne sont pas complètement inutiles, elles peuvent servir d'ancres d'histones, de tampons pour protéger l'ADN codant des radiations ou même de cadres de lecture ouverts alternatifs, mais c'est un peu secondaire.

Ce qui est particulièrement frappant dans le génome d'EBO, c'est l'uniformité de ces régions intergéniques. Les mêmes séquences sont répétées partout et la distance en pb entre les gènes est pratiquement la même dans tout le génome. Il en résulte un génome minimaliste et très condensé. En fait, il est beaucoup plus petit que le nôtre. De plus, la quantité de gènes codant pour des protéines est encore nettement inférieure à la nôtre, probablement en raison d'un raffinement génétique mais aussi de processus biologiques absents chez EBO. L'uniformité de ces séquences est un indice majeur de l'artificialité de ces êtres. Aucun organisme complexe sur terre ne présente une telle élégance dans ses séquences. Il n'y a pas de pression évolutive qui puisse conduire à ce type de caractéristiques, si ce n'est le génie génétique.

En parlant de génie génétique, après le séquençage de leurs génomes, nous avons remarqué une caractéristique troublante et universelle dans la partie 5' de la séquence régulatrice de chaque gène, que nous appelons la région tri-palindromique. Les TPR sont des séquences de 134pb contenant, comme leur nom l'indique, 3 palindromes. En génétique, un palindrome est une séquence d'ADN qui, lue dans le même sens, donne la même séquence sur les deux brins d'ADN. Ils servent à la fois de drapeau et de site de liaison pour les protéines. Les trois palindromes du TPR sont distincts les uns des autres et ont été poétiquement nommés "5'P TPR", "M TPR" et "3' TPR". Le TPR est composé (dans l'ordre 5' - 3') du TPR 5'P, de l'espaceur 12pb, de l'adresse chromosomique, de l'espaceur 12pb, du TPR M, de l'espaceur 12pb, de l'adresse du gène, de l'espaceur 12pb et du TPR 3'. L'adresse chromosomique est composée de 4 pb et est identique dans chaque TPR du même chromosome, mais distincte entre chacun des 16 chromosomes du génome. L'adresse génétique est une séquence de 64 pb qui est unique pour chaque gène dans l'ensemble du génome. Il est donc compréhensible que le TPR serve d'adresse unique non seulement pour identifier numériquement un gène, mais aussi pour identifier sa localisation chromosomique. Pour ceux qui n'ont que des connaissances de base en génétique, c'est tout à fait inédit. Aucun être vivant de notre biosphère ne possède ce type d'adresse précise dans son génome. Une fois de plus, la présence de la TPR ne peut s'expliquer par la pression de l'évolution, mais uniquement par le génie génétique à l'échelle génomique.

La TPR ouvre la voie à plusieurs possibilités. L'une d'entre elles suggère que les généticiens d'EBO peuvent insérer ou supprimer un gène d'une cellule d'une manière beaucoup plus ciblée et efficace que ne le permet notre technologie. Aucune protéine n'a été identifiée dans le génome d'EBO qui interagit avec la TPR. Nous pensons plutôt que ces protéines sont exclusivement ciblées par des outils de génie génétique externes, probablement utilisés au stade zygotique du développement embryonnaire. La nature de ces outils n'est pas claire, mais nous n'avons rien de tel. L'absence probable de ces protéines dans le génome est une indication supplémentaire de leur caractère artificiel. Étant donné la forte probabilité d'artificialité de leur génome et la facilité apparente de le modifier avec des outils biomoléculaires, il n'est pas exclu qu'il y ait un polymorphisme entre les individus selon leur rôle et leur fonction. En d'autres termes, un individu pourrait être génétiquement conçu pour avoir des caractéristiques qui lui confèrent un avantage dans l'accomplissement d'une tâche donnée, comme les fourmis soldats et les fourmis ouvrières dans une fourmilière. Il convient de noter que ces affirmations ne sont que des spéculations. À ma connaissance, seul le génome d'un individu a été séquencé, je ne peux donc pas me prononcer définitivement sur la variation génétique entre individus.

J'ai beaucoup parlé des régions intergéniques, je vais maintenant aborder brièvement les séquences intragéniques. Brièvement, parce qu'il n'y a pas grand-chose de plus à dire malgré son importance évidente. Tout comme les nôtres, leurs gènes sont dotés de silencieux, d'enhancers, de promoteurs, de 5'UTR, d'exons, d'introns, de 3' UTR, etc. Il existe de nombreux gènes analogues aux nôtres, ce qui n'est pas surprenant étant donné la compatibilité de notre machinerie cellulaire. Ce qui est troublant, c'est que certains gènes correspondent directement, nucléotide par nucléotide, à des gènes humains connus ou même à certains gènes animaux. Pour ces gènes, il ne semble pas y avoir de raffinement artificiel, mais plutôt un copier-coller grossier. La raison pour laquelle ils le font est nébuleuse et encore sujette à conjecture. Il existe également de nombreux gènes qui ne se trouvent pas dans notre biosphère et dont le rôle n'a pas été identifié. L'un des objectifs du programme est de trouver la fonction de ces nouveaux gènes. Je voudrais noter avant d'aller plus loin que cette hétérogénéité des gènes d'origine connue et inconnue est une preuve indéniable de l'artificialité des EBOs.

Pour conclure sur la génétique, le génome mitochondrial, à l'époque où j'y travaillais, n'avait pas encore été séquencé. On peut supposer que ce génome est également rationalisé et qu'il comporte peut-être une version de la TPR.

Transcription, traduction et expression des protéines.

J'ai brièvement présenté les différences de modifications post-traductionnelles entre l'homme et l'EBO. Ce n'est guère une surprise, car nous observons souvent la même chose entre différentes espèces terrestres. L'obtention d'une protéine viable à partir d'une séquence d'ADN est un processus complexe impliquant des centaines d'intermédiaires protéiques, chacun ayant un rôle précis et essentiel. Une variation mineure dans cette chaîne de montage peut entraîner des irrégularités fonctionnelles dans le produit final. Il n'est donc pas surprenant que les premières tentatives de transfection du gène EBO n'aient pas permis de produire la protéine fonctionnelle souhaitée dans des lignées cellulaires humaines. Heureusement pour nous, le travail de ce que j'imagine être une autre équipe sur un autre site a permis de développer une lignée cellulaire EBO appelée EPI-G11 dérivée de tissus épithéliaux. Grâce à cet outil, nous avons pu transfecter et surexprimer des protéines d'intérêt pour éventuellement les purifier et les étudier. Pour votre information, nous utilisons un système de livraison balistique biologique (AKA gene gun) pour nos besoins de transfection car les autres méthodes ne sont pas très efficaces avec les cellules de cette lignée. Par exemple, les vecteurs viraux testés ne peuvent pas être internalisés par EPI-G11 et la lipofection est trop létale. EPI-G11, comme la plupart des lignées cellulaires eucaryotes, entre dans une phase de croissance exponentielle lorsqu'elle est exposée à du sérum bovin fœtal. Il n'est qu'à moitié surprenant qu'une lignée cellulaire provenant d'une source aussi exotique soit sensible aux facteurs de croissance présents dans le FBS. À mon avis, cela s'explique par l'ajout de gènes animaux au génome, tels que les récepteurs de croissance.

Anatomie brute :

Ils sont morphologiquement très proches des extraterrestres gris qui font partie du folklore moderne. Ils mesurent environ 150 cm, ont deux bras, deux jambes et une tête. Il y a cependant quelques différences notables.

La peau

La peau grise souvent décrite dans le folklore est en fait un film biosynthétique qui sert probablement à protéger l'EBO d'un environnement hostile. Elle n'offre pas de protection efficace contre les changements de température, mais elle offre une protection adéquate contre le passage des liquides. Il est possible que ce film confère d'autres avantages, mais mes connaissances en la matière sont limitées. Sous le film gris, l'épiderme est plutôt blanc, la texture est très régulière et sans poils. On ne voit pas de défaut autre que les plis près des articulations. Elle est décrite comme grasse dans un rapport, mais ce n'est pas quelque chose que j'ai observé. Le même rapport indique qu'une forte odeur persistante de cheveux brûlés et d'ammoniaque est présente lorsque le film est retiré. La peau comporte de nombreux pores, qui vont de l'épiderme à une glande située dans l'hypoderme. Ces glandes et ces pores constituent la partie terminale du système excréteur-sudorifère, ce qui pourrait expliquer l'odeur mentionnée précédemment.

Tête

la tête contient deux grands yeux surdimensionnés, deux narines sans protubérance, une bouche étroite sans lèvres et deux conduits auditifs sans pavillon. Il y a une mandibule, mais la musculature est vestigiale. La cavité buccale est dépourvue de dents et de langue. La cavité nasale, où les narines se rejoignent, est compacte et ne s'élève pas crânialement mais s'étend axialement. Il ne semble pas y avoir d'équivalent du bulbe olfactif dans la cavité nasale. La bouche mène directement à l'œsophage et les fosses nasales à la trachée. La trachée et l'œsophage ne communiquent pas.

Les yeux

Comme la peau, les yeux sont recouverts d'un film biosynthétique semi-transparent qui offre la même protection environnementale, tout en assurant une protection contre certaines longueurs d'onde et certaines intensités lumineuses. Lorsque le film est retiré, un œil plus traditionnel apparaît. Il est environ trois fois plus grand qu'un œil humain et il n'y a pas de paupières. La taille de leurs yeux suggère qu'ils ont une excellente vision nocturne. Il semble paradoxal de les recouvrir d'un film semi-opaque. Peut-être n'ont-ils besoin de le porter que dans un environnement lumineux. La sclérotique est de la même couleur que la peau, l'iris est gris pâle et la pupille est noire et surdimensionnée. Le cristallin est plus rond que celui d'un humain et la musculature utilisée pour faire la mise au point est plus développée. Sur la rétine, il existe au moins 6 types de cellules coniques. La réactivité de chacun de ces 6 types de cônes est spécifique à une bande de longueur d'onde, avec un minimum de chevauchement entre eux. Il en résulte un spectre visible plus large.

L'oreille

Comme nous l'avons mentionné, l'oreille externe n'a pas de pavillon et le conduit auditif n'est pas remarquable. L'oreille interne présente toutes les caractéristiques d'un système vestibulaire et cochléaire typique, bien que la courbure de la cochlée soit plus prononcée que chez l'homme. Cela se traduit probablement par une plus grande acuité auditive pour les basses fréquences.

Le cerveau

Le cerveau est tétrasphérique, c'est-à-dire composé de quatre sections principales. Les sections sont séparées par des fissures transversales et longitudinales et sont reliées au lobe central, qui fait office de tronc cérébral et de cervelet. Le volume du cerveau est supérieur d'environ 20 % à celui d'un homme de même taille. Il présente un niveau de giration beaucoup plus prononcé que celui d'un humain moyen. De plus, le rapport entre les cellules gliales et les neurones est également légèrement plus élevé que chez l'homme. Il est important de mentionner la présence de nodules sur le lobe central. L'analyse histologique de ces structures révèle une sorte de circuit biologique complexe. On suppose que ces nodules sont essentiels pour interagir avec leur technologie. Par conséquent, la détermination du protéome de ces structures est une priorité absolue pour le programme.

Le cou

Le cou est proportionnellement plus long que celui d'un humain, tout en étant relativement fin. Comme nous l'avons vu, l'œsophage et la trachée sont séparés. Il n'y a pas de cordes vocales dans cette région.

Thorax

La musculature du thorax est peu développée. On peut voir des muscles équivalents au grand pectoral. On voit également les muscles trapèze et deltoïde. Les sterno-cléido-mastoïdiens sont bien définis. Les côtes et le sternum sont bien visibles. Il n'y a pas de mamelons.

L'abdomen

L'abdomen est plus large que le thorax et légèrement bombé vers l'avant. Il n'y a pas de nombril.

Bassin

les os du bassin sont apparents. Il n'y a pas d'organes génitaux ni d'anus.

Mains et pieds

Les mains ont quatre doigts, dont un pouce opposable sur le côté médian. Ils n'ont pas d'ongles et la texture de leurs empreintes digitales est composée de cercles concentriques. Les doigts sont proportionnellement beaucoup plus longs que chez l'homme. Contrairement à l'homme, la musculature des doigts est entièrement intrinsèque à la main. En d'autres termes, les muscles utilisés pour bouger les doigts ne se trouvent pas dans les avant-bras, mais entièrement dans les mains. À première vue, les pieds ne comportent que deux doigts, mais une nécropsie a rapidement permis de déterminer que chaque orteil était constitué de deux doigts fusionnés. L'orteil médian est légèrement plus long que l'orteil distal. Les pieds sont relativement plus longs et plus étroits que chez l'homme. Leur musculature est cependant vestigiale.

L'endosquelette des EBO est très similaire au nôtre, du moins en termes de composition. On y trouve du collagène, de l'hydroxyapatite, mais aussi des cristaux d'oxyde de cuivre à la place de la moelle. Le rôle de ces cristaux n'a pas été établi, mais il ne s'agit pas d'une cristalopathie. Les cellules sanguines de la lignée myéloïde (ou l'équivalent pour ces créatures) mûrissent donc dans un endroit différent de celui de l'homme, c'est-à-dire dans l'organe semblable au thymus. Une coupe transversale de l'os révèle la présence d'ostéons et d'ostéocytes. Il semble y avoir peu d'ostéoblastes et pas d'ostéoclastes. Cela indique que les os ne sont plus en croissance et qu'ils ne peuvent pas absorber les minéraux présents ou s'adapter mécaniquement aux changements de posture.

Système biologique :

Système respiratoire : Leur respiration cellulaire est équivalente à la nôtre, c'est-à-dire qu'ils doivent oxyder des composants organiques pour produire de l'énergie. Leurs poumons n'ont pas d'action réciproque, mais un flux d'air unidirectionnel, semblable à celui des oiseaux, qui est plus efficace que le nôtre. On suppose que c'est en réponse aux besoins métaboliques élevés du cerveau. La vocalisation est produite par la vibration de la membrane de la paroi à la jonction entre les deux sacs aériens.

Le système circulatoire des EBO est assez analogue au nôtre. Le cœur est situé dans le médiastin, mais dans une position plus médiane, directement sous le sternum. Le cœur comporte deux ventricules et deux oreillettes. Il y a une aorte, une veine pulmonaire, une artère pulmonaire et une veine cave. Le sang qui s'écoule vers les capillaires pulmonaires via l'artère pulmonaire est pompé à contre-courant de l'air, ce qui maximise l'efficacité des échanges gazeux. La barrière des gaz sanguins est relativement étroite dans ces capillaires, du moins par rapport à l'homme. Le sang riche en oxygène est ensuite renvoyé vers le cœur, puis expulsé vers l'aorte et le reste du corps. Avant de retourner au cœur, le sang passe par l'organe hépatorénal qui, entre autres, filtre et contrôle la pression osmotique du sang.

Le sang lui-même est également analogue à celui d'un humain. Cependant, la proportion de plasma est beaucoup plus élevée, l'albumine est en proportion similaire, les niveaux d'hormones sont beaucoup plus bas, les niveaux d'ions métalliques sont beaucoup plus élevés (en particulier le cuivre) et les niveaux de glucose sont significativement plus élevés. La couleur du sang est brunâtre, en raison de la plus grande proportion de plasma et de la concentration en ions métalliques. Sur le plan cellulaire, on trouve des érythrocytes qui, en plus de l'hémoglobine pour fixer l'oxygène, présentent plusieurs complexes capables de fixer les ions cuivre. Le rôle de ces ions cuivre n'est pas clair, mais on pense qu'ils neutralisent notamment l'ammoniaque du sang. Plusieurs types de cellules présentant des caractéristiques leucocytaires ont été observés, mais il n'existe pas de connaissances exhaustives à leur sujet. Les plaquettes sont présentes, mais dans des proportions moindres que chez l'homme.

Système excréteur-sudorifère

Ce système est complètement différent de ce que j'ai vu. Comme mentionné précédemment, il n'y a pas de grand orifice, comme l'anus ou l'urètre, pour se débarrasser des déchets biologiques. Au lieu de cela, il y a d'innombrables petits pores à la surface de la peau. Il existe un grand organe médian appelé organe hépatorénal, qui joue à la fois le rôle de rein et de foie et joue un rôle central dans le maintien de l'homéostasie. Cet organe est très vascularisé et le sang doit le traverser avant de retourner au cœur. Son rôle est, entre autres, de purifier le sang des déchets métaboliques. Les déchets sont excrétés dans l'équivalent d'un uretère, qui se ramifie en quatre. Chaque branche se dirige vers l'un des quatre membres et, à leur tour, ces branches se divisent pour aboutir à des milliers de pores excréteurs. La motilité de ce système excréteur est assurée par un faible péristaltisme au niveau proximal et sur les quatre branches principales. Le péristaltisme s'arrête autour de la première jonction distale. Comme il n'y a pas de cycle de l'urée, la concentration d'ammoniac à la sortie de l'organe hépatorénal est très élevée. Cet ammoniac est transporté vers les pores et donne l'odeur distincte que j'ai mentionnée plus haut. La raison d'être de ce système excréteur inhabituel est directement liée à l'ammoniac excrété, qui permet la thermorégulation en s'évaporant à la surface de la peau. Plus l'effort physique est important, plus le métabolisme augmente. Celui-ci entraîne une élévation de la température et une augmentation correspondante des déchets métaboliques via le catabolisme des acides aminés. Il en résulte une augmentation de la filtration et de l'excrétion d'ammoniaque, ce qui, en fin de compte, abaisse la température corporelle.

Système digestif

Le système digestif est extrêmement peu développé. Il n'y a pas d'estomac au sens familier du terme. Il existe cependant un pseudo-estomac situé à la transition entre la cavité thoracique et la cavité abdominale. Cet organe ne participe pas à la digestion, mais sert uniquement de réservoir. Un sphincter contrôle l'écoulement des aliments dans l'intestin. L'intestin se limite à l'équivalent de notre intestin grêle, c'est-à-dire qu'il ne sert qu'à absorber les liquides et les nutriments et constitue le principal site de digestion. Il possède des villosités et des microvillosités comme le nôtre. L'intestin se termine dans l'organe hépato-rénal, où les matières non digérées sont transportées vers l'uretère et le système excréteur. Les résidus sont dissous dans l'ammoniac des déchets métaboliques pour être excrétés. Un organe situé près du sphincter pseudo-omacal sécrète des enzymes digestives directement dans l'intestin. Cet organe est appelé par inspiration l'organe digestif. Il sécrète principalement des enzymes protéolytiques et des glycosides hydrolases.

Compte tenu de l'absence de dents, de l'étroitesse et de la rigidité de l'œsophage, de l'absence d'un véritable estomac et de l'absence de défécation, on croit fermement que les EBO ne peuvent consommer des aliments que sous forme liquide. On suppose que, compte tenu des besoins métaboliques élevés de leur cerveau, cette nourriture aurait une forte concentration en hydrates de carbone. Afin de répondre à d'autres besoins métaboliques, la nourriture consommée doit également avoir une forte teneur en protéines. Ces deux affirmations sont étayées par le type d'enzymes sécrétées par l'organe digestif. On peut donc supposer que la nourriture consommée est une sorte de bouillon riche en sucre et en protéines, qui a probablement aussi une forte teneur en cuivre. Étant donné les limitations strictes du type de nourriture qu'ils peuvent consommer, il est peu probable que ce type de créature puisse survivre dans notre biosphère sans soutien technologique.

Système endocrinien

Les connaissances sur le système endocrinien sont minimales. On sait que les cellules sont réceptives aux hormones de croissance bovine, on suppose donc que certaines fonctions sont régulées par un tel système. Les mécanismes endocriniens sont très complexes et il va sans dire qu'ils sont mieux étudiés sur des sujets vivants.

Le système immunitaire

Le système immunitaire est une autre inconnue. Il semble y avoir un système immunitaire inné, mais il ne semble pas y avoir d'immunité adaptative, du moins pas semblable à ce que l'on connaît. Près du cœur, il y a un organe semblable au thymus qui est proportionnellement plus grand que chez l'homme. Cet organe semble être le lieu de maturation de toutes les cellules sanguines. Certaines cellules présentent des caractéristiques leucocytaires telles que la granularité. Les cellules immunitaires qui germent ici ont une forte concentration en cuivre. Les récepteurs de surface des cellules immunitaires innées n'ont pas encore été caractérisés, autant dire que tout le travail reste à faire.

Le système nerveux

Le système nerveux est lui aussi relativement similaire. La moelle épinière commence à la base du lobe central du cerveau et se propage le long de la colonne vertébrale. Dans les vertèbres, on trouve des ganglions constitués de neurones afférents et efférents. Bref, en dehors du SNC, il n'y a rien d'extraordinaire.

L'appareil locomoteur

Le système musculo-squelettique est très ordinaire, bien que peu développé. La plupart des muscles du squelette humain ont un équivalent. Seuls les mains, les pieds et les avant-bras sont différents. Il faut noter que la proportion de fibres musculaires de type 1 et de type 2 est différente de celle de l'homme. En effet, les fibres de type 1 sont environ 10 fois plus nombreuses que les fibres de type 2.

Système artificiel

Nous supposons que des machines moléculaires artificielles peuvent être présentes dans le corps, et que le cuivre, s'il est présent, serait essentiel à leur fonctionnement ou à leur assemblage. Il est important de noter qu'aucune machine moléculaire artificielle n'a été observée.

Question 1 :

Une histoire étonnante. En avez-vous fait part à la Commission sénatoriale sur le renseignement ou à l'AARO et avez-vous des preuves à l'appui ?

Merci, non je ne l'ai pas fait et non je ne le ferai pas. Cela ressemble à un piège à miel. Je ne mettrai pas ma vie entre les mains de politiciens. Je n'ai pas d'autre preuve que ce message. Je sais que ce n'est pas grand-chose, mais c'est ce que je suis prêt à offrir.

Question 2

Eh bien, c'était une lecture... Il s'agit donc d'abeilles ouvrières issues de la bio-ingénierie... Y a-t-il des composants élémentaires qui ne sont pas attribuables à notre biome ?

Oui, sachant qu'elles sont jetables, incapables de vivre de manière autonome sans soutien technologique, et qu'elles sont éphémères. La seule hypothèse valable est qu'ils ne sont vivants que pour accomplir leur tâche. Pouvez-vous clarifier votre question sur les composants élémentaires ?

Question 3

Je n'ai pas tout lu en détail mais pouvez-vous développer le document sur leur religion ?

Les EBO pensent que l'âme n'est pas une extension de l'individu, mais plutôt une caractéristique fondamentale de la nature qui s'exprime sous la forme d'un champ, un peu comme la gravité. En présence de vie, ce champ acquiert de la complexité, ce qui se traduit par une entropie négative, si l'on peut dire. Ce gain de complexité est directement corrélé à la concentration d'organismes vivants en un lieu donné. Avec le temps, et si les conditions sont réunies, la vie se complexifie à son tour jusqu'à l'apparition de la vie sensible. Après avoir atteint ce seuil, le champ commence à s'exprimer à travers ces êtres sensibles, formant ce que nous appelons l'âme. Par leurs expériences de vie, les êtres sensibles influencent à leur tour le champ dans une sorte de boucle de rétroaction positive. Cela accélère encore la complexité du champ. Finalement, lorsque le champ atteindra une "masse critique", il y aura une sorte d'apothéose. On ne sait pas très bien ce que cela signifie en termes pratiques, mais cette quête d'apothéose semble être la principale motivation des EBO.

L'auteur du document a ajouté ses réflexions et interprétations en annexe. Il précise que, pour eux, le champ de l'âme n'est pas une croyance mais une vérité évidente. Il affirme également que l'âme perd son individualité après la mort, mais que la mémoire et l'expérience persistent en tant que partie du champ. Ce fait influencerait la philosophie et la culture des EBO, aboutissant à une société qui ne craint pas la mort mais qui n'accorde aucune importance ou révérence à l'individualité. Cette "croyance" les oblige à ensemencer la vie, à la façonner, à la nourrir, à la surveiller et à l'influencer dans le but ultime de créer cette apothéose. Paradoxalement, ils n'ont que peu ou pas de respect pour le bien-être de l'individu.

Veuillez noter que je parle de mémoire d'un texte que j'ai lu il y a plus de 10 ans, alors prenez ce qui suit avec un grain de sel. De plus, je ne suis ni philosophe ni artiste, alors veuillez excuser ma difficulté à formuler correctement les concepts et ma terminologie aride. Enfin, notez que ces informations proviennent d'un document dont l'auteur était en interaction directe avec un OEB. Il n'est pas précisé s'il s'agissait d'un ambassadeur, d'un survivant d'un crash, d'un prisonnier. Les moyens de communication ne sont pas non plus précisés.

Question 4 : Wtf il a laissé tomber l'emplacement du laboratoire

Battelle National Biodefense Institute. C'est sur google map

Nous rapportons des extensions expérimentales de Lenia, une famille d'automates cellulaires continus capable de produire des modèles autonomes auto-organisés réalistes. La règle de Lenia a été généralisée à des dimensions supérieures, à des noyaux multiples et à des canaux multiples. L'architecture finale se rapproche de ce qui peut être considéré comme un réseau neuronal convolutif récurrent. En utilisant la recherche semi-automatique, par exemple l'algorithme génétique, nous avons découvert de nouveaux phénomènes comme les symétries polyédriques, l'individualité, l'auto-réplication, l'émission, la croissance par ingestion, et nous avons vu l'émergence d'"eucaryotes virtuels" qui possèdent une division interne du travail et une différenciation des types. Nous discutons des résultats dans les contextes de la biologie, de la vie artificielle et de l'intelligence artificielle.

https://doi.org/10.48550/arXiv.2005.03742

https://arxiv.org/pdf/2005.03742.pdf

Rappelons que DNA Script est une jeune pousse française qui a été fondée en 2014 à Paris. À l’origine d’une technologie innovante de synthèse enzymatique d’ADN, l’imprimante est baptisée « Enzymatic DNA Synthésis » ou EDS. Pour aboutir à l’impression d’ADN, elle a été intégrée dans une sorte d’imprimante à ADN spécialement dédiée aux laboratoires. De cette façon, la Syntax est en mesure d’élaborer jusqu’à 96 fréquences d’ADN personnalisées en quelques heures. Pour ce faire, elle utilise des cartouches contenant des enzymes naturelles. Une telle avancée technologique est tout à fait exploitable dans la recherche en génomique comme dans la biologie moléculaire. En tout cas, ce mécanisme ingénieux est bien plus rapide que les méthodes classiques.

Comme nous l’avons évoqué plus haut, la machine ne requiert ni l’utilisation de solvants, ni d’un environnement contrôlé. Elle n’utilise donc pas les procédés de synthèse chimique commerciaux. En seulement 15 minutes, l’instrument de DNA Script est configurable, et ce, de façon automatisée. En plus de cela, elle peut être déployée au sein des laboratoires, offrant ainsi la possibilité de mieux contrôler et d’améliorer l’efficacité de leur productivité. Les entreprises pharmaceutiques pourront donc innover en ce sens, et gagner en rapidité dans la production des ADN.

La cellule est riche en surfaces biopolymères. Pourtant, le rôle de ces surfaces et des interfaces surface-eau correspondantes n'a guère retenu l'attention des biologistes, qui considèrent pour la plupart l'eau comme un vecteur neutre. Cette revue a pour but de commencer à combler le fossé entre la biologie et la science des interfaces, afin de montrer qu'une approche orientée vers les surfaces a le pouvoir d'apporter un éclairage nouveau dans un labyrinthe autrement impénétrablement complexe. Dans cette approche, la cellule est traitée comme un gel polymère. Si la cellule est un gel, une approche logique de la compréhension de la fonction cellulaire passe par la compréhension de la fonction du gel. De grands progrès ont été réalisés récemment dans la compréhension des principes de la dynamique polymère-gel, et en particulier du rôle de l'interface polymère-eau. Il est devenu évident qu'un mécanisme central en biologie est la transition de phase - un changement structurel majeur provoqué par un changement subtil de l'environnement. Les transitions de phase sont capables d'effectuer un travail et ce travail pourrait être responsable d'une grande partie du travail de la cellule. Nous poursuivons ici cette approche. Nous avons mis en place une base polymère-gel pour le comportement cellulaire, et nous explorons dans quelle mesure cette base explique comment la cellule accomplit ses tâches quotidiennes.

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