" En changeant les repas, en enlevant la lumière, en ne pouvant pas mesurer le temps avec une montre, on se décale tous les jours un petit peu plus"
Francesca Siclari, spécialiste du sommeil au CHUV de Lausanne

Nathaniel Kleitman, un mois enfermé dans une grotte.
Ce scientifique, né en 1895 et passionné par le sommeil, a créé le premier laboratoire spécialisé au monde sur ce thème à l’Université de Chicago. Pour mener ses recherches, il a beaucoup testé ses hypothèses sur lui-même.
Coupés du monde à 42 mètres de profondeur

En 1938, lui et son assistant Bruce Richardson s’enferment pendant trente-deux jours dans la grotte Mammouth au Kentucky, aux Etats-Unis. A 42 mètres de profondeur, avec une température constante de 12 degrés et sans lumière naturelle, ils sont coupés du monde réel. Leur nouvelle chambre est aménagée de façon rustique: un lit superposé, une table et quelques lanternes.

Pendant l’expérience, les deux hommes adoptent un emploi du temps particulier: dormir neuf heures, travailler pendant dix heures, redormir neuf heures… ce qui fait une journée de vingt-huit heures.

Après trente-deux jours, Bruce Richardson, âgé de 20 ans, dort comme un bébé sur un rythme de vingt-huit heures et déclare s’être adapté en une semaine. Le spécialiste du sommeil, âgé de 43 ans à l’époque, continue de son côté à vivre sur un rythme de vingt-quatre heures, s’endormant à 10 heures du soir pour se lever le lendemain à 8h, malgré les contraintes de son nouvel emploi du temps.

Selon Nathaniel Kleitman, la différence entre les deux scientifiques viendrait de leurs âges respectifs. Quand on est jeune, notre corps s’adapte mieux aux changements de rythme.

Ce que vous devez savoir

L'augmentation du stress, les changements de poids et d'exercice, et d'autres changements importants dans le mode de vie peuvent affecter les cycles menstruels - et tous ces changements sont courants pendant la pandémie de COVID-19. De plus, des études ont montré que certaines femmes ayant eu le COVID-19 ont connu des changements dans la durée et le flux de leurs cycles menstruels.

Mais les modifications du cycle menstruel ne se limitent peut-être pas aux personnes ayant contracté le COVID-19. Récemment, certaines personnes ont signalé des changements dans leurs menstruations après avoir reçu le vaccin COVID-19, y compris des changements dans la durée, le flux et les symptômes d'accompagnement tels que la douleur.
Que vont faire les chercheurs ?

Pour savoir s'il existe un lien entre la vaccination et les changements dans les menstruations, le Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development (NICHD) a récemment publié un avis d'intérêt spécial pour les chercheurs afin de comparer les expériences de menstruation des personnes vaccinées et non vaccinées. Le NICHD soutiendra des recherches axées sur les menstruations avant et après la vaccination, sur la manière dont le vaccin affecte les menstruations et sur l'influence d'autres facteurs, tels que le stress, sur ces changements menstruels.
Pourquoi cette recherche est-elle importante ?

Comme de plus en plus de personnes continuent à se faire vacciner contre le COVID-19, il sera important de comprendre les effets à court et à long terme du vaccin sur la santé reproductive. Les preuves scientifiques aideront également les personnes non vaccinées à comprendre les éventuels effets secondaires du vaccin COVID-19 liés aux menstruations.
Où puis-je aller pour en savoir plus ?

Avis d'intérêt spécial (NOSI) pour encourager les demandes de supplément administratif pour étudier la vaccination COVID-19 et les menstruations

Le NICHD appelle les chercheurs à étudier les effets du vaccin COVID-19 sur les menstruations.

Menstruations et problèmes menstruels

Le NICHD partage des informations sur les menstruations et les irrégularités du cycle menstruel.

Question de recherche

L'infection par le SRAS-CoV-2 a-t-elle un effet sur la réserve ovarienne, les hormones sexuelles et les menstruations des femmes en âge de procréer ?
Conception

Il s'agit d'une étude rétrospective et transversale dans laquelle les données cliniques et de laboratoire de 237 femmes en âge de procréer diagnostiquées avec le COVID-19 ont été examinées rétrospectivement. Les données menstruelles de 177 patientes ont été analysées. Des échantillons de sang prélevés au début de la phase folliculaire ont été testés pour les hormones sexuelles et l'hormone anti-müllérienne (AMH).
Résultats

Parmi les 237 patients dont le COVID-19 a été confirmé, les patients gravement malades présentaient plus de comorbidités que les patients légèrement malades (34 % contre 8 %), en particulier pour les patients atteints de diabète, de maladie hépatique et de tumeurs malignes. Sur 177 patientes ayant un dossier menstruel, 45 (25 %) ont présenté des modifications du volume menstruel, et 50 (28 %) des modifications du cycle menstruel, principalement une diminution du volume (20 %) et un allongement du cycle (19 %). Les concentrations moyennes d'hormones sexuelles et d'AMH des femmes en âge de procréer atteintes de COVID-19 n'étaient pas différentes de celles des témoins appariés selon l'âge.
Conclusions

Les concentrations moyennes d'hormones sexuelles et la réserve ovarienne n'ont pas changé de manière significative chez les femmes COVID-19 en âge de procréer. Près d'un cinquième des patientes ont présenté une diminution du volume menstruel ou un allongement du cycle. Les modifications des menstruations de ces patientes pourraient être la conséquence de changements transitoires des hormones sexuelles causés par la suppression de la fonction ovarienne, qui reprennent rapidement après la guérison.

Recherche de différences dans les propriétés du bois en fonction de la date d'abattage : variations corrélées à la phase lunaire dans le comportement de séchage de l'épicéa commun ( Picea abies Karst.) et du châtaignier ( Castanea sativa Mill.)

Une expérience de terrain à grande échelle sur le comportement de séchage de l'épicéa commun (Picea abies Karst.) et du châtaignier (Castanea sativa Mill.) en fonction de la date d'abattage a été menée sur une période de 24 semaines afin d'étudier l'existence de variations liées aux rythmes lunaires, qui sont mentionnés comme ayant un rôle dans de nombreuses pratiques forestières traditionnelles. Les critères mesurés étaient la perte d'eau de l'état frais à l'état sec, le retrait lié à cette perte d'eau, et la densité relative (rapport entre la densité sèche et la densité fraîche initiale) pour l'aubier et le duramen de Picea et le duramen de Castanea. En plus des tendances saisonnières, des variations légères mais significatives avec les périodicités lunaires (synodiques et sidérales ; dans une moindre mesure tropiques) caractérisent les trois critères étudiés. Ces rythmicités lunaires sont présentes à la fois chez Picea et Castanea, dans le bois de cœur et l'aubier. Ces résultats soulèvent de nouvelles questions et perspectives sur le caractère rythmique de la relation bois-eau.

Depuis plus de 2000 ans, certaines pratiques et règles forestières concernant l'abattage des arbres sont effectuées en fonction des cycles lunaires. Un examen général des différents types de règles suivies (connues en Europe et sur d'autres continents et provenant à la fois de sources écrites et de praticiens actuels) montre que des utilisations spéciales du bois sont mentionnées en relation avec une date d'abattage spécifique qui est censée garantir des propriétés avantageuses du bois.

Ces traditions forestières empiriques s'appliquent à une gamme d'utilisations du bois aussi diverses que le bois de construction, les bardeaux, les cheminées en bois, le bois de chauffage, le bois de résonance pour les tables d'harmonie des violons, les boîtes à fromage, les tonneaux et les charrues. Dans chacun de ces cas, l'abattage à la "bonne date" est considéré comme un facteur important pour garantir les propriétés requises du produit. En outre, le flottage du bois était limité à certains jours du cycle lunaire, lorsque l'eau était censée transporter le bois de la meilleure façon.

La deuxième partie présente des études scientifiques portant, d'une part, sur le facteur "phases de la Lune". Elles traitent d'éléments de la biologie des arbres tels que la germination et la croissance initiale des arbres tropicaux (où des variations fortes et systématiques et leurs aspects compliqués ont été observés), les attaques d'insectes sur les arbres et les fluctuations réversibles du diamètre des tiges. D'autre part, certains ouvrages se concentrent sur les propriétés du bois et la relation entre le bois et l'eau. Ils traitent de la durabilité du bois, des variations systématiques de la densité après séchage au four et des variations de la résistance à la compression des échantillons correspondants. Une synthèse tente de trouver un lien commun entre les pratiques empiriques et les résultats scientifiques.

https://doi.org/10.1016/j.micinf.2020.08.004

Notre laboratoire a décidé de fournir aux cliniciens des résultats quantitatifs, désormais utilisés non seulement pour les soins aux patients, mais aussi pour évaluer la contagiosité, c'est-à-dire que les valeurs inférieures à 1000 copies/ml peuvent être considérées comme présentant un faible risque de transmission.

Ce qui était traduit par:
"A partir de quel seuil de CT un positif n’est plus contagieux ?

Pour répondre à cette question de manière formelle, il faudrait avoir des données épidémiologiques sur les transmissions secondaires à partir des sujets documentés positifs par notre laboratoire. La contagiosité est probablement faible voire négligeable au-delà d’un Ct de 36, correspondant à environ 1000 copies/ml (Jacot et al. Microbes Infect. 2020 Sep 7 doi: 10.1016/j.micinf.2020.08.004). Cependant, la contagiosité ne dépend pas que de la charge virale, mais également d’autres paramètres tel que la toux ou/et la présence d’un écoulement nasal. Ainsi, le laboratoire ne rend qu’un résultat quantitatif et ne donne pas d’informations additionnelles sur la contagiosité potentielle. Au vu des charges virales élevées généralement observées, il est logique et pragmatique de considérer a priori que tout patient positif et symptomatique pourrait être contagieux."
=> https://lilianeheldkhawam.com/2020/10/04/rt-pcr-le-professeur-greub-du-chuv-de-lausanne-repond-a-nos-questions-interview/

Quelle est la borne supérieure admise en valeur de CT pour estimer qu’un test est positif ?

Dans notre laboratoire, nous n’avons pas fixé de seuil. Le nombre maximal de CT est différent selon la méthode et correspond au nombre maximal de cycles effectués.

En l’occurrence, nous utilisons 3 types de RT-PCR SaRS-CoV-2 distinctes :

    Une RT-PCR utilisant une extraction Magnapure (Roche) suivit d’une retro-transcription et amplification à l’aide de machines de type Applied Biosystems, avec des sondes Taqman; le tout est automatisé à l’aide de 3 robots Hamilton. Avec cette plateforme automatisée, nous faisons 45 cycles d’amplification. 

    Une RT-PCR appelée « Cobas », commercialisée par Roche, avec un maximum de 50 cycles.  

    Une RT-PCR appelée « GeneXpert», commercialisée par Cepheid, avec un maximum de 45 cycles.  (https://www.cepheid.com/en/systems/GeneXpert-Family-of-Systems/GeneXpert-System)

Nous n’avons donc pas fixé de seuil. Par contre, nous avons mis en place une surveillance par rapport à cette problématique de possibles faux positifs et ce dès le début (14 février 2020), notamment en comparant les résultats obtenus d’un même patient, ainsi que les résultats obtenus à l’aide des RT-PCRs ciblant 2 gènes distincts. Afin de faire face au grand nombre d’analyses reçues, nous avons d’ailleurs automatisé la comparaison des résultats provenant d’un même patient
(Mueller et al. https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.07.27.20162123v1).

En quoi les tests RT-PCR sont-ils de mauvais tests de contagiosité ?

Tout d’abord, le test RT-PCR n’est pas un test de la présence du virus mais un test de la présence de séquences génétiques du virus. Or les personnes peuvent excréter des séquences virales sans pour autant excréter de virus vivants. C’est une première raison qui fait que l’on peut être positif à la RT-PCR sans pour autant être contagieux. Par exemple 20, 30 voire 45 jours après le début des symptômes. Deuxième raison : la RT-PCR fonctionne par répétition de cycles de multiplication de la quantité des séquences génétiques cibles présentes dans l’échantillon d’origine jusqu’à atteindre une quantité détectable. C’est ce qui fait la puissance de cette technique : en poussant le nombre de cycles, on peut arriver à détecter de très petites quantités de matériel génétique. Mais c’est aussi un écueil pour mesurer la contagiosité. Car il faut qu’une personne excrète une dose minimale de virus pour qu’elle puisse être contagieuse. C’est le cas pour toute maladie virale : il faut être en contact avec une quantité minimale de virus, ce que l’on appelle l’inoculum, pour être infecté. Avec les dizaines de cycles de PCR utilisés dans les labos pour les tests, on peut très bien sortir positif alors qu’on n’excrète qu’une trop faible quantité de virus pour être contagieux ou à tout le moins pour être fortement contagieux.

he Centers for Disease Control and Prevention said it is examining the use of cycle threshold measures “for policy decisions.” The agency said it would need to collaborate with the F.D.A. and with device manufacturers to ensure the measures “can be used properly and with assurance that we know what they mean.”

The C.D.C.’s own calculations suggest that it is extremely difficult to detect any live virus in a sample above a threshold of 33 cycles. Officials at some state labs said the C.D.C. had not asked them to note threshold values or to share them with contact-tracing organizations.

Officials at the Wadsworth Center, New York’s state lab, have access to C.T. values from tests they have processed, and analyzed their numbers at The Times’s request. In July, the lab identified 872 positive tests, based on a threshold of 40 cycles.

With a cutoff of 35, about 43 percent of those tests would no longer qualify as positive. About 63 percent would no longer be judged positive if the cycles were limited to 30.

In Massachusetts, from 85 to 90 percent of people who tested positive in July with a cycle threshold of 40 would have been deemed negative if the threshold were 30 cycles, Dr. Mina said. “I would say that none of those people should be contact-traced, not one,” he said.

62 ans cycle d'envoie de neutrino dans le noyau cristallin de la terre... et ça le réchauffe de quelques centaines de degrés. Ce qui met 8 mois à arriver au moho. ceci est généralement compensé par la capacité de l'océan à absorber le co2 de l'atmosphère.. mais à cause du plastique.. ça ne marche plus.